Πολλοι ιστορικοι θεωρουν παντως οτι οι φιλικοι ηταν μασονοι. Και για τον Καποδιστρια ισχυει αυτο. Αν αναλογιστουμε τωρα τη μυστικοτητα που επρεπε να υπαρχει, τα συμβολα της φιλικης εταιριας και το οτι στην Ευρωπη η μασονια ηταν πολυ διαδεδομενη την εποχη εκεινη, ειναι πολυ πιθανο να ειναι ετσι τα πραγματα. Εξαλλου η μασονια δεν ειναι κατι εξ ορισμου κακο.