Τις κατηγορίες της απιστίας και της άμεσης συνέργειας σε απιστία αντιμετωπίζουν 13 πρώην στελέχη του ΟΣΕ για ενέργειές τους οι οποίες φέρεται να ζημίωσαν τον Οργανισμό την περίοδο 2004-2007, επί υπουργίας του Μιχάλη Λιάπη.
Η εισαγγελέας Πρωτοδικών Πόπη Παπανδρέου, έχει σχηματίσει δικογραφία που περιλαμβάνει τρία σκέλη. Το πρώτο να αφορά την αλλαγή των προδιαγραφών για την προμήθεια τροχαίου υλικού του ΟΣΕ, το δεύτερο σκέλος αφορά την καθυστέρηση της παράδοσης από τον ανάδοχο του ολοκληρωμένου πληροφοριακού συστήματος διαχείρισης επιβατικών μεταφορών του ΟΣΕ και το τρίτο σχετίζεται με την ενοικίαση από τον ΟΣΕ οκτώ συρμών τύπου Desirο. Τους συρμούς αυτούς ο οργανισμός τους ενοικίασε με 1 εκατ. ευρώ το μήνα, για δεκαέξι μήνες. Ωστόσο ο ΟΣΕ θα μπορούσε να αποκτήσει τα τρένα δωρεάν ως τήρηση ρήτρας για τη μη έγκαιρη παράδοση του καινούργιου τροχαίου υλικού από την κοινοπραξία Siemens-Ελληνικά Ναυπηγεία, σύμφωνα με το ΑΠΕ.